Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DYNC1LI2O43237 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms