Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBTB39O15060 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms