Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCER2I3L3R5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms