Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCBP2LA6PVI3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms