Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms