Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GJA5-202ENST00000579774 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAT-208ENST00000520356 4273 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ANGPT4-201ENST00000381922 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090197.1-202ENST00000519692 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK4-205ENST00000588540 3144 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SPECC1-201ENST00000261503 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 COL6A3-205ENST00000392004 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF438-207ENST00000452305 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MOV10L1-209ENST00000540615 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS6-219ENST00000622468 5453 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF568-202ENST00000415168 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf62-201ENST00000251143 3894 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011815.1-201ENST00000586922 4382 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AMPD2-202ENST00000342115 3728 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 COL4A4-201ENST00000396625 9895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms