Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITGB6-205ENST00000428609 2576 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PROM2-202ENST00000317668 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SOX9-AS1-204ENST00000434703 3032 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NVL-216ENST00000482491 3003 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TLR9-201ENST00000360658 3870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 POLR1E-201ENST00000377792 2229 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CD44-201ENST00000263398 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC139099.4-201ENST00000625083 3504 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 BACH2-202ENST00000343122 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEMA4A-201ENST00000355014 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL592158.1-201ENST00000632210 4477 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FRMPD2-202ENST00000374201 4997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC37A2-203ENST00000576629 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC7-204ENST00000415775 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 C3P1-201ENST00000495140 3526 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 POLDIP3-203ENST00000348657 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL592114.3-201ENST00000437919 446 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms