Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTBP1-219ENST00000629223 210 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LACTB2-AS1-201ENST00000499227 3716 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 C11orf57-209ENST00000532163 3739 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOCS4-204ENST00000555846 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAD1-202ENST00000358196 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAZ3-203ENST00000446723 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAZ2-209ENST00000449947 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NKAIN2-202ENST00000368417 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIGIT-203ENST00000481065 3710 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF1L-201ENST00000242310 6216 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRO-204ENST00000375041 3488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACBD5-203ENST00000375901 3685 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF111167.2-201ENST00000560419 4059 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAMSAP2-203ENST00000413307 4498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PROM2-202ENST00000317668 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EARS2-207ENST00000563459 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105105.1-201ENST00000591360 2553 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF138-202ENST00000261593 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSMAF-201ENST00000038176 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARP6-201ENST00000260376 2142 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCTN3-207ENST00000614499 2739 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM16-201ENST00000336708 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIMAP6-203ENST00000618759 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNFRSF19-201ENST00000248484 3276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ISX-202ENST00000404699 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL596202.1-201ENST00000435295 3088 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKMP2-201ENST00000412159 1677 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms