Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms