Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RHBDD3Q9Y3P4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RHBDD3Q9Y3P4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RHBDD3Q9Y3P4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RHBDD3Q9Y3P4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RHBDD3Q9Y3P4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RHBDD3Q9Y3P4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RHBDD3Q9Y3P4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms