Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG6Q9Y2V7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms