Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1DQ9Y2S0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms