Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms