Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPCN1Q9ULQ1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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