Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms