Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX41Q9UJV9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX41Q9UJV9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms