Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KDM5BQ9UGL1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM5BQ9UGL1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM5BQ9UGL1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms