Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms