Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MED9Q9NWA0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED9Q9NWA0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms