Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms