Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEPPQ9NTK1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms