Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A2Q9NTI2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A2Q9NTI2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms