Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLE3Q9NRF9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms