Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms