Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms