Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSER1Q9C0I3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms