Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms