Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZC3H12CQ9C0D7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms