Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms