Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPEF2Q9C093 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF2Q9C093 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms