Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIN2AQ99865 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms