Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms