Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms