Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms