Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMPDL3BQ92485 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMPDL3BQ92485 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms