Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF548Q8NEK5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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