Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms