Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZIC4Q8N9L1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC4Q8N9L1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms