Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CLIP4Q8N3C7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP4Q8N3C7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLIP4Q8N3C7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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