Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC84Q86UT8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms