Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms