Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC1Q6TDU7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms