Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms