Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMBOX1Q6NT76 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMBOX1Q6NT76 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMBOX1Q6NT76 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMBOX1Q6NT76 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMBOX1Q6NT76 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMBOX1Q6NT76 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMBOX1Q6NT76 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms