Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms