Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms