Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZK1Q5T2W1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms