Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZC3H13Q5T200 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H13Q5T200 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms