Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCID2Q5JVF3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms