Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TDRD12Q587J7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms